Czas wolny Otto poświęcał na eksperymentowanie. Wsławił się doświadczeniami z półkulami magdeburskimi i wynalazkiem pompy pneumatycznej.
Oprócz badania zjawisk związanych z próżnią, zainteresowany przez Williama Gilberta kontynuował jego doświadczenia z elektryczności. Guericke jako pierwszy zbudował maszynę elektrostatyczną w postaci siarkowej kuli. Swoje badania w dziedzinie elektryczności Guericke opublikował w książce "Nowe doświadczenia", która wyszła drukiem w 1672 roku. Otto Guericke zajmował się również astronomią, policzył okresowość powrotu komet. W 1681 zrezygnował z posady burmistrza i przeniósł się do Hamburga, gdzie zmarł 15 maja 1686 roku.